После событий предыдущих картин Мегамозг окончательно оставил путь суперзлодея, получил официальный статус супергероя Метро-Сити и привык к спокойной жизни, посвященной помощи горожанам и защите города от угроз. Но его размеренное существование рушится в одночасье, когда в город возвращается команда его старых приспешников, объединившихся под названием Синдикат рока с новыми зловещими планами.
