История разворачивается в Японии, где главная героиня, старшеклассница Тоцуко Хигураси, учится в католической школе и с детства видит мир в оттенках, привязанных к людям. Её особенно привлекает глубокий синий цвет, которым сияет одноклассница Кими — тихая, замкнутая девушка, которая неожиданно перестаёт приходить на занятия, и все попытки одноклассников связаться с ней остаются без ответа.
